食品微生物学检验的主要任务是以国家食品卫生标准为依据，利用食品微生物学、生物化学、免疫学、遗传学和分子生物学的理论与技术，研究食品中致病菌的生物学特性、致病菌的检验方法，为食品被食品加工环境及食品卫生情况做出正确的评价，快速、准确对食品中的常见病原菌的种类和数目进行快速准确的检验。常用的食品微生物学检验技术包括：食品样品的采集与处理、显微镜技术、染色技术、培养基制备技术、消毒与灭菌技术、微生物的分离纯化与培养技术、细菌与真菌的形态学观察、生理生化检验技术、PCR技术、电泳技术以及酶联免疫吸附技术等。

食品微生物学检验是食品质量控制方面的重要技术和手段，通过对食品微生物检测可以：1）判定食品能否被食用的科学依据之一；2）衡量食品加工环境及食品卫生情况；3）为食品被细菌污染的程度做出正确评价； 3）对食品中常见的致病菌进行快速、准确的定性与定量检验；4）为食品的监管工作提供科学依据；5）为人和动物的食物中毒提供防治措施。